4．2．7．7  禁止為了提高畜禽群體的生產力而使用抗生索、抗球蟲藥和其他生長促進劑，禁止使用激素控制畜禽的生殖行為(例如誘導發情，同期發情、超數排卵)。但激素可在獸醫監督下用于對個別動物進行疾病治療。

 4．2．8  非治療性手 

4．2．8．1  允許采用以下非治療性手術，但應盡量減少給動物帶來的痛苦，必要時可使用麻醉劑：

    a．為了保持產品質量和傳統生產習慣而進行的閹割(肉豬、牛、雞)；

    b．斷角；

    c．為了防止蠅蛆病而進行的羔羊斷尾；

    d．剪羽。

 4．2．8．2  禁止進行以下非治療性手術；

    a．斷尾(除羔羊外)；

    b．剪喙；

    c．燒翅；

    d．其他沒有明確允許的非治療性手術。

4．2．9．繁殖

4．2．9．1  提倡自然繁殖。

 4．2．9．2  允許采用不對畜禽的遺傳多樣性產生嚴重限制的各種繁殖方法。

4．2．9．3  禁止使用胚胎移植技術。

4．2．10  運輸和屠宰

4．2．10．1  屠宰的有機畜禽必須來自有機養殖場。

4．2．10．2  畜禽在裝卸、運輸、待宰和屠宰期間必須有專人負責照料，并使動物遭受的脅迫和痛苦降低降到最低限度。

4．2．10．3  市禽在運輸過程中必須清楚地標記。

4．2．10．4  當用車輛運輸時，運到屠宰場的時間不應超過8小時，根據具體情況可有例外。在例外的情況下，必須給畜禽喂食、喂水。

4．2．10．5  禁止使用電棒及類似設備驅趕動物。禁止在運輸前和運輸過程中，對動物使用鎮靜劑或興奮劑。

4．2．10．6  必須在國家衛生防疫部門批準的屠宰場宰殺畜禽。

4．2．10．7  禁止在帝禽失去知覺之前，就進行捆綁、懸吊和屠宰。

4．2．10．8  有機畜禽和常規畜禽應分別屠宰，屠宰后應分別存放并清楚標記。

4．2．11  奶制品

    奶制品生產除滿足4．2．1～4．2．10的畜禽養殖標準外，還必須滿足以下要求：

4．2．11．1  允許使用附錄E中物質對奶制品加工設備進行清洗和消毒，并標則其用途和正確的使用方法。所有使用過清潔劑的設施必須得到徹底的清洗，以保證在設備和奶制品中沒有清潔劑殘留。

4．2．11．2  有機牛奶至少必須符合常規牛奶的衛生要求及質量標準。建議牛奶中年均體細胞數不能超過400 000個／m1 (800 000綿羊或山羊)；細菌數最大不得超過10 000個／ml。建議每月分析一次每頭奶牛產奶中的體細胞含量。如果沒有達到這些質量標準，則要求制定滿足這些標準的計劃，并提交有機食品認證機構枇準。對新的畜群，在認證前3個月，奶汁中平均體細胞數就應低于400 000個／ml(800