（五）企業因遷址、進行生產工藝或設備重大技術改造等原因使生產條件發生重大變更時，或者開發生產新資源食品時，或者企業生產與生產許可證核準的產品不同并且生產必備條件差異較大時，應當在變化后3個月內向質量技術監督部門提出《食品生產許可證》變更申請（附十二）。質量技術監督部門應當針對發生變化的項目，按照《食品生產許可證》申請、審查的程序和要求，實施必要的生產必備條件審查和產品檢驗。
在生產許可證有效期內，產品標準發生變化的，由國家質檢總局組織有關專家提出重新檢驗和評審方案，由各省級質量技術監督部門組織進行補充審查。
（六）對于委托加工實施生產許可證管理的食品和其產品標識標注，按照國家質檢總局《關于委托加工實施生產許可證管理的產品標識有關問題的通知》（國質檢[2001]41號）的規定執行。
（七）國家質檢總局和省級質量技術監督局應當按計劃組織承擔食品檢驗工作的檢驗機構和自行從事食品出廠檢驗的企業的檢驗能力進行比對試驗。對達不到能力要求和不能客觀、公正地出具檢驗數據的檢驗機構，取消其檢驗資格；不能保證自行檢驗要求的，責令企業進行出廠委托檢驗。
（八）各級質量技術監督部門根據《中華人民共和國產品質量法》、《工業產品生產許可證試行條例》及《工業產品生產許可證管理辦法》等有關規定，負責對無證食品生產銷售的違法行為進行查處。無證查處的范圍和起始時間由國家質檢總局統一公布。
（九）各級質量技術監督部門在實施食品質量安全市場準入制度時，要及時建立食品企業質量檔案。質量檔案應當包括企業名稱、企業負責人（法人代表）姓名及身份證號碼、營業執照編號、衛生許可證編號、企業代碼、產品種類、企業經濟類型、企業人數、企業規模、生產能力、實際產量、執行標準、生產設備、檢驗設備、原材料把關、出廠檢驗、抽查檢查情況、投訴情況等信息。
（十）各級質量技術監督部門應當使用國家質檢總局編制的食品質量安全監督管理系統軟件，利用計算機管理企業質量信息，逐步實現利用計算機（網絡）接收、存儲和傳遞各級質量技術監督部門之間的管理數據。
（十一）各級質量技術監督部門應當定期采集更新企業有關信息，定期向同級人民政府報告本地區的食品質量安全狀況，并向國家質檢總局上報有關情況及數據。

十三、收費問題
根據《工業產品生產許可證試行條例》、《工業產品生產許可證管理辦法》和《加強食品質量安全監督管理工作實施意見》（本文）的有關規定，企業申請《食品生產許可證》應當繳納費用。