原因：企業自我規范意識不強是主要原因。有的企業認為搞GMP認證只是一種形式，所有的文件材料或請他人來做，或直接拷貝已通過認證企業的材料,并臨時聘請相關人員應付認證檢查,卻不加強自身建設和員工培訓，造成認證時一個樣，認證后又是另一個樣。另外，GMP認證制度還不完善也是影響認證效果的一個重要原因。

    對策：打防結合，有力排除干擾因素。一是把好制度關。要分門別類對企業的各種不良認證行為建立處罰機制，并建立相關管理制度，起到預警作用。二是把好申報資料的源頭關。要求企業在申報資料時如實提供相關資料，對有特殊要求的品種或工序等要做出單獨、具體的說明，否則按弄虛作假處理。三是把好申報資料的審核關。對審核材料過程中發現的問題要詳細記錄，并將需要注意的問題寫在檢查方案里，及時、準確地提醒檢查組注意。四是把好企業重要信息的監控關。要對各企業的重要信息進行網上實時監控，如企業主要的領導、質量和生產部門負責人、顧問等重要人員名單要上網，并規定這些人要和醫生一樣注冊上崗，注冊以后不得在其他企業同時再注冊，有效防止企業弄虛作假，欺騙檢查組。