中華民國七十八年五月二十四日經濟部食品GMP推行會報核定
中華民國八十年十月十七日經濟部食品GMP推行會報核定修正
中華民國八十一年一月二十八日經濟部食品GMP推行會報核定修正
中華民國八十一年九月十八日經濟部食品GMP推行會報核定修正
中華民國八十四年五月六日經濟部食品GMP推行會報核定修正
中華民國八十六年三月三十一日經濟部食品GMP推行會報核定修正
中華民國八十九年二月十一日經濟部食品GMP認證體系推行委員會核定修正

  一、為推動食品GMP認證體系，以促進食品工廠實施食品良好作業規范（簡稱食品GMP），依據經濟部公告「食品良好作業規范（GMP）推行方案」第參條之規定，訂定本規章。
二、食品GMP認證體系由食品GMP認證體系推行委員會（以下簡稱推行委員會）依業務性質委托適當之專業機構為認證或推廣宣導執行機構。認證執行機構系負責執行資料審查、產品檢驗、追蹤管理等食品GMP認證作業，并辦理食品GMP相關之廠商輔導及技術發展等工作；推廣宣導執行機構系負責辦理食品GMP推廣宣導、匯總廠商配合款及食品GMP認證合約書之簽約與代發認證書等工作。
專業執行機構應逐年研提工作計劃并與推行委員會召集單位簽訂委辦合約書，且應接受推行委員會之監督考核，如有重大違失者，推行委員會得隨時中止委托關系。
三、專業執行機構為執行推行委員會之委托業務，應于接受委托后，聘用專任人員組成食品GMP執行部門積極推展業務。
四、食品GMP認證體系之認證標志（以下簡稱認證標志）經推行委員會召集單位制定并依法注冊在案。凡未獲推行委員會同意，擅自使用或仿冒認證標志者，推行委員會除透過大眾傳播媒體公布擅用者外，并函請相關主管機關依法辦理。
五、食品GMP認證體系之適用對象，在中華民國境內，應為領有經濟部工廠登記證之食品工廠。
六、申請食品GMP認證之工廠，應符合「食品GMP認證體系細部作業程序」（如附件一）及「食品GMP認證體系查驗評定基準」（如附件二）之規定。
申請食品GMP認證之工廠，應依產品類別、產品特性及廠房位置之不同予以區分。
七、申請食品GMP認證之工廠，于通過查驗（包括現場評核及產品檢驗）并由認證執行機構報請推行委員會秘書處確認后，再與經推行委員會授權之推廣宣導執行機構簽訂「食品GMP認證合約書」（如附件三）并獲授認證標志使用權。
前項合約書之有效期間為一年，期滿自動終止，雙方如有意續約應另行簽訂之。簽約后由推廣宣導執行機構代理推行委員會核發「食品GMP認證書」（如附件四），其有效期間同合約書。