3.用于有機作物和食品生產的微生物必須來自自然界，不使用來自基因工程的微生物種類。


 

4．嚴禁使用人工合成的化學肥料、污水、污泥和未經堆制的腐敗性廢棄物。


 

5．在有機農業生產系統內實行輪作，輪作的作物品種應多樣化。提倡多種植豆科作物和飼料作物。


 

6．主要使用本系統生產的、經過1～6個月充分腐熟的有機肥料，包括沒有污染的綠肥和作物殘體、泥炭、蒿桿、海草和其它類似物質以及經過堆積處理的食物和林業副產品．經過高溫堆肥等方法處理后，沒有蟲害、寄生蟲和傳染病的人糞尿和畜禽糞便可作為有機肥料使用．也可以使用系統外未受污染的有機肥料，但應有計劃地逐步減少使用的數量。


 

7．可以在非直接生食的多年生作物以及至少4個月后才收獲的直接生食作物上使用新鮮肥、好氣處理肥、厭氣處理肥等。但是，供人們食用的蔬菜不允許使用未經處理的人畜糞尿。


 

8.允許使用自然形態（未經化學處理)的礦物肥料。使用礦物肥料，特別是含氮的肥料(如：干血、泥漿等)時，不能影響作物的生長環境以及營養、味道和抵抗力。


 

9．允許使用木炭灰、無水鉀鎂礬、未經處理的海洋副產品、骨粉、魚粉和其它類似的天然產品，以及液態或粉狀海草提取物，允許使用職務或動物生產的產品，如生長調節劑、輔助劑、濕潤劑、礦物懸浮液等。


 

10．禁止使用硝酸鹽、磷酸鹽、氯化物等營養物質以及會導致土壤重金屬積累的礦渣和磷礦石。


 

11.允許使用農用石灰、天然磷酸鹽和其它緩溶性礦粉．但天然磷酸鹽的使用量，不能使總氟含量平均每年每畝超過0.35公斤，溫室平均每年每畝超過0.7公斤。


 

12．允許使用硫酸鉀、鋁酸鈉和含有硫酸鹽的痕量元素礦物鹽．在使用前應先把這些物質配制成溶液，并用微量的噴霧器均勻噴灑。


 

13.嚴禁使用人工合成的化學農藥和化學類、石油類以及氨基酸類除草劑和增效劑，提倡生物防治和使用生物農藥(包括植物、微生物農藥)。


 

14．允許使用石灰、硫磺、波爾多液、殺（霉）菌和隱球菌和皂類物質、植物制劑、醋和其它天然物質來防治作物病蟲害。但含硫或銅的物質以及魚藤酮、除菌菊和硅藻土必須按附錄中的規定使用。


 

15．允許使用皂類物質、植物性殺蟲劑(如：魚尼丁、泥巴草等)和微生物殺蟲劑(見附錄)以及外激素、視覺性和物理捕蟲設施防治蟲害．


 

16．提倡用平衡施肥管理、早期苗床準備和預先打穴、地面覆蓋結合采用限制雜草生長發育的栽培技術(輪作、綠肥、休閑)等措施以及機械、電力、熱除草和微生物除草劑等方法來控制和除掉雜草．可以使用塑料薄膜覆蓋方法除草，但要避免把農膜殘留在土壤中。