申請有機食品認證企業（單位），須按《有機食品認證技術準則》的要求，建立并完善涵蓋如下內容的管理體系：

    （一）質量管理手冊

    質量管理手冊是闡述企業質量管理方針目標、質量體系和質量活動的綱領指導性文件，對質量管理體系作出了恰當的描述，是質量體系建立和實施中所應用的主要文件，即是質量管理體系運行中長期遵循的文件。質量保證手冊的主要內容包括：

    （1）企業概況

    （2）開始有機食品生產的原因、生產管理措施

    （3）企業的質量方針

    （4）企業的目標質量計劃

    （5）為了有機農業的可持續發展，促進土地管理的措施。

    （6）生產過程管理人員、內部檢查員以及其它相關人員的責任和權限。

    （7）組織機構圖、企業章程等。

    （二）、操作規程

    所有的操作規程都是為了將《質量保證手冊》具體化的程序和方法的文件，必須經過企業內部的共同討論通過并切實地實行。

    1）、作物栽培部分

    （1）、作物栽培部分操作規程

    ①種子和種苗的選定及處理辦法

    ②田地的準備方法

    ③播種及育苗

    ④基肥和追肥的制作方法

    ⑤基肥和追肥的施肥管理方法

    ⑥病、蟲草害防除的方法

    ⑦包括豆科作物在內的輪作制度

    ⑧對來自水源及周邊的污染的防范和處理辦法

    ⑨異常和問題發生時的處理或報告方法

    ⑩收獲的方法（包括防止與普通農產品混合的措施和不合格產品的處理）

    （2）、原料收獲的管理規程

    ①收獲方法

    ②有機原料識別批次號編號方法

    ③從收獲到出貨的各道工序的批次號編號管理方法

    （3）、收獲后的各道工序的規程

    ①從田地到加工廠的運送方法

    ②加工廠的接貨檢查程序　

    ③篩選、加工、清洗的作業程序

    ④臨時保管方法（與普通農產品的區分方法、有機標示等）

    ⑤包裝程序

    ⑥不合格產品的處理方法

    （4）、出貨規程

    ①保管方法

    ②出貨的程序（如何與普通農產品的區分方法）

    ③不合格產品的處理

    （5）、機械、設備的維修、清掃規程

    ①使用前的清洗方法

    ②維修方法

    ③滅菌消毒方法

    （6）、客戶投訴的處理

    ①投訴的處理方法

    ②投訴處理記錄的完成方法

    ③投訴原因的調查、改正及預防措施

    （7）、給認證機構的報告及接受檢查規程

    ①認證機構的檢查計劃

    ②年度栽培計劃、實際栽培結果、收獲累計、生產損耗及不合格產品的數量、分客戶的銷售業績。

    （8）、記錄管理規程

    ①完成和修訂各種規程及文本數據的方法

    ②完成、修訂后的新文本的使用方法

    （9）、內部檢查規程

    ①內部檢查的實施計劃　

    ②內部檢查的責任和權限