由于公眾及各產業對ISO9001：2000版本的肯定響應，因此在2008版本中將不會做出實質性的結構更改，并且標準的范圍、目的、標題及應用領域將不會更改，而P-D-C-A過程方法也將會得到保留。
 
作為標準的核心價值，八項質量管理原則將會完整地保留下來，而ISO 9001與ISO 9004之間的一致性及績效改進的方針同樣會在兩大標準的修訂版中得以保留。
 
ISO 900：2008版本的修改包括了一些細小的修改，用以維持標準、增強標準的自我解釋能力，并制定ISO 9001與ISO 14001及其它部分特別標準，如TL 9000、ISO/TS 16949、ISO 22000、ISO 17799等之間的兼容性。 
ISO9001：2000
ISO9001：2008
0.1 總則
本標準能用于內部和外部（包括認證機構）評定組織滿足顧客、法律法規和組織自身要求的能力。
0.1 總則
本標準能用于內部和外部（包括認證機構）評定組織滿足顧客、適用于產品的法律法規和組織自身要求的能力。
 

界定需滿足的法律法規的范圍：適用于產品的法律法規，突出標準所關注的是組織產品和/或服務的質量。
 
ISO9001：2000
ISO9001：2008
0.4 與其他管理體系的相容性
為了使用者的利益，本標準與ISO 14001：1996相互趨近，以增強兩類標準的相容性。
0.4與其他管理體系的相容性
為了使用者的利益，本標準開發中考慮到與ISO 14001：2004相互趨近，以增強兩類標準的相容性。
 

增強標準的兼容性，有利于建立整合型的管理體系（IMS）。
 
ISO9001：2000
ISO9001：2008
1.1 總則
注：在本標準中，術語"產品"僅適用預期提供給顧客或顧客要求的產品。
1.1 總則
注1：在本標準中，術語"產品"適用于預期提供給顧客或顧客所要求的產品，這也包括采購產品和實現過程的中間產品。
注2：法律法規可表述為法定要求。
 

擴大了產品的范圍，包括材料和半成品。
 
ISO9001：2000
ISO9001：2008
2 引用標準
ISO9000：2000
3 術語和定義
本標準表述供應鏈：
供方         組織         顧客
2 引用標準
ISO9000：2005
3 術語和定義
取消了供應鏈的描述

 
ISO9001：2000
ISO9001：2008
4.1 總要求
a）識別(identify)質量管理體系所需的過程及其在組織中的應用。
對此類外包過程的控制應在質量管理體系中加以識別（be identified）.
4.1 總要求
a）確定（determine）質量管理體系所需的過程及其在組織中的應用.
用于外包過程的控制應在質量管理體系中加以規定（be defined） 。
增加注2：本標準7.4條款的要求也可適用于外包過程 。