質量認證現場審核的目的是證實受審核方(以下稱企業)的質量管理體系或產品質量符合ISO9001：2000標準或特定產品標準以及法律法規的要求，從而表明企業的質量管理體系或產品質量經認證合格，并作為向其顧客提供信任的證據。同時，按照ISO9001：2000標準"持續改進總體業績應當是組織的一個永恒目標"的原則，企業應當利用現場審核發現的不符合項尋找持續改進的機會，以積極的態度發動職工尋找不合格的原因，并采取有效措施以絕后患，從而使質量管理水平躍上一個新的臺階。如果企業只是采用批評、懲罰、扣獎金等簡單方法處理審核中發現的不合格項，就很難取得使審核過程增值、確保實現審核目標的效果。
　　可是，一些企業在獎懲制度中規定，被發現不合格項的部門將受到扣除獎金的處罰。做出這樣的規定，可能會使受審核部門或職工不愿與審核人員進行有效合作，甚至產生對立情緒并在審核時弄虛作假。在這種情況下，審核人員難以得到真實的信息或難以下決心開具不合格報告。一般而言，企業的哪個部門工作項目多、數量大，產生不合格項的可能性也相應增大。同時，審核采取抽樣的方法進行，沒有被審核的部門可能也存在不合格項。即使在某個部門發現了不合格，也不表明該部門就一定是責任者。所以，如果發現了不合格就處罰，必然打擊某些部門和職工的積極性，不利于企業質量管理體系的不斷完善和持續改進。
　　在對待不合格項的態度和處理方法上，日本豐田汽車公司為我國企業提供了有益的啟示。該公司對出現的各種問題和事故一不批評、二不懲罰、三不扣獎金，而是對責任者追問5個為什么。例如，面對一臺出現故障的機器，管理者與操作者進行了這樣的對話：
　　問：機器為什么停了?答：超負荷，保險絲斷了。
　　問：為什么超負荷?答：軸承潤滑不夠。
　　問：為什么潤滑不夠?答：油泵吸不上油。
　　問：為什么吸不上油?答：油泵軸承磨損松動。
　　問：為什么磨損松動?答：沒有安裝過濾器，混進了鐵屑。
　　問完了5個為什么，事故的原因也水落石出了。于是，企業決定舉一反三，全面安裝過濾器，問題得到了徹底解決。
　　因此，作為以持續改進總體業績為永恒目標的企業，不能使用簡單的懲罰或經濟處罰等方法處理審核中發現的不合格項，而應該主動追根溯源，舉一反三，予以糾正，杜絕不合格的重復發生。